Terobsesi dengan racun dan obat-obatan, seorang pelayan di istana Kaisar memakai kemampuannya sebagai penyembuh di distrik hiburan malam untuk memecahkan kasus misterius.

Di dunia yang dilanda makhluk yang dikenal sebagai Kaiju, Kafka Hibino bercita-cita untuk mendaftar di Angkatan Pertahanan. Dia berjanji untuk mendaftar wajib militer dengan teman masa kecilnya, Mina Ashiro. Tak lama kemudian, kehidupan membawa mereka ke arah yang berbeda. Saat bertugas membersihkan setelah pertempuran Kaiju, Kafka bertemu Reno Ichikawa. Tekad Reno untuk bergabung dengan Angkatan Pertahanan membangkitkan kembali janji Kafka untuk bergabung dengan Mina dan melindungi umat manusia.

Setelah bertaruh untuk membuktikan bahwa hantu atau alien sungguh ada, dua murid SMA bertemu aneka makhluk seram, mendapat kekuatan super, dan mungkin juga jatuh cinta?!

Mengisahkan Ars Louvent yang bereinkarnasi di sebuah dunia lain menjadi anak dari keluarga bangsawan. Pada dasarnya, Ars tidak memiliki kekuatan khusus. Namun, sejak lahir ia memiliki kemampuan dalam menilai status orang lain.Maka dari itu, Ars memanfaatkan kekuatan tersebut dengan merekrut berbagai orang berbakat guna mengubah wilayahnya menjadi lebih baik lagi. Tentu, hanya orang-orang tertentu yang akan Ars rekrut sebagai prajuritnya.

Setahun berlalu sejak pelepasan Suaka, di mana Subaru berhasil menang dari pertarungannya dengan kelinci dan melakukan kontrak dengan roh agung, yaitu Beatrice. Fraksi Emilia akhirnya bersatu sebagai kandidat pemilihan kerajaan. Natsuki Subaru juga menjalani kehidupan yang memuaskan.

Namun, kedamaiannya berakhir ketika sebuah undangan untuk Emilia dari Anastasia, salah satu kandidat raja, untuk datang ke Pristella, kota gerbang air yang merupakan satu dari lima kota besar di Lugunica. Di sana, berbagai reuni telah menanti Subaru. Dari yang tidak terduga, tak terbayangkan, dan satu per satu yang lain datang. Krisis yang belum pernah terjadi sebelumnya muncul dari bawah permukaan. Sekali lagi, Subaru akan menghadapi nasib yang kejam.

Setelah mengalahkan Wethermon, Sunraku dan teman-temannya menjelajah ke area-area yang belum terpetakan. Di sana, para sekutu baru, musuh, dan monster unik telah menanti.